Nématodes se nourrissant des plantes et stratégie de lutte

Elisabeth Darling 1, Marisol Quintanilla-Tornel1, Henry Chung1*

1Département d’entomologie Université d’État du Michigan, États-UnisLes racines des plantes interagissent avec un grand nombre de bactéries, de champignons et d’organismes microscopiques présents dans le sol qui peuvent avoir une incidence sur la croissance des plantes. Certains de ces organismes microscopiques sont des animaux appelés nématodes ; ils constituent une partie particulièrement importante de la vie souterraine. Les nématodes peuvent être bénéfiques, nuisibles ou neutres pour les plantes. Certains scientifiques appelés nématologistes étudient les nématodes et les moyens d’empêcher ceux qui sont nuisibles de ravager des cultures importantes, comme les carottes. Des nématologistes et d’autres scientifiques travaillent main dans la main pour aider les agriculteurs à gérer ces nuisibles et à produire des cultures saines.

DE PETITS ORGANISMES PEUVENT CAUSER D’ÉNORMES PROBLÈMES

Une poignée de terre contient des milliers d’animaux si petits que nous avons besoin d’un microscope pour les voir. Ces animaux ont beau être minuscules, certains d’entre eux ont une incidence mondiale sur la production efficace de cultures vivrières.

Les nématodes (Figure 1) sont de petits vers ronds qui vivent dans la terre de nos jardins, des champs de culture et des paysages. Si certains nématodes sont utiles pour les végétaux, d’autres sont de véritables ennemis. Ces nématodes dangereux se nourrissent des racines des plantes, ce qui finit par les endommager et nuire à leur croissance. Lorsqu’ils se nourrissent, les nématodes blessent les racines, les rendant potentiellement vulnérables aux infections par d’autres organismes pathogènes présents dans le sol1. Les nématodes qui endommagent les racines des plantes sont souvent appelés des parasites.

Figure 1: Nématode mangeur de racines mâle de l’espèce Pratylenchus, prélevé sur des racines de carotte. Pour se rendre compte de l’échelle, 100 µm sont 10 fois plus petits que 1 mm et correspondent à peu près à la largeur d’un cheveu humain !

NÉMATODES QUI SE NOURRISSENT DES PLANTES : UNE MENACE POUR LES CULTURES DE LEGUMES-RACINES

Certaines plantes potagères possèdent des racines comestibles, comme les carottes, les betteraves, les panais et les pommes de terre. Les nématodes peuvent endommager ces cultures vivrières importantes, mais aussi beaucoup d’autres. Les nématodes possèdent une bouche en forme de tube qui injecte un mélange d’enzymes dans la plante pour décomposer ses cellules et les transformer en soupe. Une fois les cellules décomposées, les nématodes ingèrent cette soupe2. Lorsque les nématodes mangent les racines des carottes au tout début de la vie de la plante, ils peuvent provoquer de sérieux dégâts, voire la mort de la plante. Lorsque des nématodes parasitaires des plantes dévorent les carottes et les panais au début de la saison de production, ils endommagent les racines à tel point que les agriculteurs ne peuvent pas les vendre. En particulier, quand les nématodes du genre Pratylenchus se nourrissent des très jeunes carottes, les dégâts occasionnés aux racines entraînent un dédoublement des carottes (Figure 2). Lorsqu’un grand nombre de nématodes parasitaires des plantes sont présents dans le sol, les pertes de récoltes peuvent être importantes.

Les nématologistes sont des scientifiques qui étudient les nématodes. Les nématologistes qui font des recherches sur les nématodes parasitaires des plantes peuvent travailler avec les agriculteurs afin de tester l’efficacité des produits capables d’éradiquer les nématodes dangereux et de trouver les meilleurs résultats pour lutter contre ces nuisibles. Les nématodes qui se nourrissent des légumes-racines sont particulièrement difficiles à gérer, car les agriculteurs ne parviennent pas toujours à identifier les symptômes d’une infestation de nématodes avant la fin de la saison, une fois les racines récoltées.

COMMENT UNE INFESTATION DE NÉMATODES EST-ELLE DIAGNOSTIQUÉE ?

Contrairement aux insectes ravageurs, les nématodes ne sont pas visibles à l’œil nu, la confirmation d’une infestation de nématodes nécessite donc des tests en laboratoire. Si un agriculteur craint des dégâts par des nématodes parasitaires des plantes, il peut envoyer un échantillon de terre prélevé dans son champ à un laboratoire de nématologie. Au laboratoire, la terre est mélangée avec de l’eau et passée au tamis, lors d’un processus similaire au tamisage de la farine. L’objectif est de retirer les gros morceaux de sable et autres débris de la terre pour capter uniquement les nématodes. Le mélange est transféré dans des tubes qui sont ensuite placés dans une centrifugeuse, une grosse machine qui tourne très vite pour déplacer les particules les plus denses au fond des tubes. Les nématodes flottent dans l’eau alors que les particules de sable et de boue plus lourdes restent au fond des tubes. Une solution sucrée est ensuite ajoutée aux tubes pour faire remonter les nématodes à la surface. Les scientifiques récupèrent les minuscules animaux et les examinent à l’aide d’un microscope optique pour identifier les espèces de nématodes présentes dans le champ de l’agriculteur. {Jenskins} Certaines espèces de nématodes ressemblent cependant tellement à d’autres qu’elles doivent être identifiées en analysant leur ADN.

COMMENT LES AGRICULTEURS PEUVENT-ILS GÉRER LES NÉMATODES ?

Les nématologistes et d’autres scientifiques travaillent ensemble pour résoudre les problèmes auxquels les agriculteurs font face avec les nématodes. Il existe des produits chimiques appelés nématicides qui sont actuellement utilisés pour traiter les infestations de nématodes. Ces produits chimiques sont toxiques pour les nématodes, mais peuvent également l’être pour la personne qui les répand, et ils sont également coûteux.

Les nématologistes cherchent d’autres moyens efficaces pour aider les agriculteurs à gérer ces nuisibles. Certains types de bactérieset de champignons3 présents dans le sol ont des propriétés nématicides, ce qui signifie qu’ils peuvent tuer ou enrayer les nématodes, et certains sont si spécialisés qu’ils n’attaquent que les nématodes nuisibles4. De nombreuses études en cours tentent d’identifier et de cultiver ces espèces bénéfiques afin qu’elles puissent être utilisées dans les champs des agriculteurs pour réduire les populations de nématodes nuisibles dans la terre. Le nématicide le plus souhaitable serait néfaste uniquement pour les nématodes parasitaires des plantes afin de garantir que les ressources souterraines et autres organismes microscopiques utiles présents dans la terre soient préservés.

CHAMPIGNONS ET BACTÉRIES : UNE SOLUTION POTENTIELLE POUR LUTTER CONTRE LES NÉMATODES PARASITAIRES DES PLANTES

Les nématodes parasitaires des plantes sont des nuisibles dangereux qui peuvent endommager les racines des plantes et entraîner d’importantes pertes financières pour les agriculteurs dont les récoltes sont invendables. C’est pourquoi il est important de trouver des moyens efficaces de gérer les nématodes parasitaires des plantes. Idéalement, ces traitements devraient être sans danger pour l’environnement et les autres espèces vivant dans la terre et devraient également être abordables pour les agriculteurs. Cela représente un défi considérable pour les nématologistes, mais l’avenir est prometteur ! La principale solution potentielle consiste à trouver des types de champignons ou de bactéries du sol capables de contrôler les nématodes parasitaires de plantes afin de mettre au point de nouveaux produits efficaces et écologiques que les agriculteurs puissent utiliser. Par ailleurs, l’utilisation de l’ADN des nématodes pour identifier les différentes espèces de nématodes présentes dans la terre a permis de faire avancer le domaine de la nématologie.

La science moléculaire comme l’analyse d’ADN peut parfois être coûteuse, mais, en travaillant de concert, les scientifiques peuvent faire des progrès en matière de techniques moléculaires qui feront baisser le coût du processus pour les futurs scientifiques et agriculteurs. Ces techniques ouvriront la voie aux équipes de nématologistes et leurs partenaires scientifiques et leur permettront de trouver les meilleurs moyens de contrôler ces dangereux nuisibles.

GLOSSAIRE

Nématodes

Groupe d’animaux (phylum : Nematoda) ayant one forme de ver long et cylindrique. Ils sont présents sur le sept continents (même en Antarctique !), ainsi que dans les océans et les lacs.

Parasites

Organisme qui dépend d’un autre organisme hôte pour trouver son alimentation et ses nutriments.

Enzymes

Molécules biologiques qui produisent des réactions chimiques dans les cellules.

Nématologistes

Scientifiques qui étudient les nématodes.

ADN

Instructions requises pour constituer les cellules qui composent chaque organisme.

Nématicide

Substance ou on organisme capable de tuer efficacement les nématodes.

Bactéries

Groupe d’organisme procaryotes, ce qui signifie qu’ils n’ont pas de noyau et ne possèdent qu’une seule cellule.

Champignons

Groupe d’organisme eucaryotes (dont les cellules possèdent un noyau) qui se nourrissent de matière organique. Ce groupe comprend les champignons et les levures comestibles, ainsi que le mildiou et les moisissures.

RÉFÉRENCES

• Shah, M. M. et Mahamood, M. Nematology: Concepts, Diagnosis and Control. (BoD – Books on Demand, 2017). - Zunke, U. Observations on the Invasion and Endoparasitic Behavior of the Root Lesion Nematode Pratylenchus penetrans. J Nematol22, 309–320 (1990). - Poveda, J., Abril-Urias, P. et Escobar, C. Biological Control of Plant-Parasitic Nematodes by Filamentous Fungi Inducers of Resistance: Trichoderma, Mycorrhizal and Endophytic Fungi. *Front. Microbiol.*0, (2020). - Topalović, O., Elhady, A., Hallmann, J., Richert-Pöggeler, K. R. et Heuer, H. Bacteria isolated from the cuticle of plant-parasitic nematodes attached to and antagonized the root-knot nematode Meloidogyne hapla. Sci Rep9, 11477 (2019).

ÉDITÉ PAR: Malte Jochum, German Centre for Integrative Biodiversity Research (iDiv), Germany

TRADUCTRICE

AUDREY LOSFELD DUTOIT

Audrey s’est toujours intéressée à la nature. Sa saison préférée est le printemps, quand tout est en fleur et paré de mille couleurs. Petite, elle adorait chercher les coccinelles et les escargots dans le jardin et regarder des reportages sur les animaux. Quand elle ne planche pas sur une traduction, elle aime jouer avec ses deux enfants de 1 et 3 ans (notamment à chercher les papillons et les coccinelles !), regarder des séries avec leur papa et cuisiner de bons petits plats pour toute la famille.

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